吾妻川は草津白根山を源とする酸性の強い河川でありましたが、国や県の力によって本来の水に中和され平成５年には第五種共同漁業権が認可されました。

当漁協も第五種共同漁業権にかかる各魚種放流事業を実施していますが冷水病・カワウによる被害対策は当漁協にとって大きな課題となっているため県当局の指導のもとに組合をあげて改善に取り組んでおります。

また、幼稚園児童に「漁協地域住民交流推進事業：さかな放流式」に参加していただき、河川環境の大事さを学んでもらうなど、地域社会で開催しています。